2067年，在恐怖電影節中博得人氣的「看不見的朋友」即將上映前夕，全國各地陸續發生看過電影的觀眾，見到離奇幻覺而死亡的案件。薪懷疑可能是利用狂牛病感染的犯罪行為，因此委託正在服刑的塔吉克協助調查…

在小學裡，因不幸的巧合疊加而發生一件哀傷的意外。 接著在哀傷的深淵當中，一名父親引發不幸的事件。 不過是連續的巧合，任誰都那麼想…除了薪以外。 逼近青木，美少年‧須田光的魔手是？ 與死者腦部有關的精湛懸疑作品，惡作劇（遊戲）篇，啟動…！

２０６１年，世人的話題環繞著睽違７５年後，再次接近的哈雷彗星。就在那樣的情況下，發生了「偉人」們的「腦部」全被奪走的奇妙案件。到底是誰，為了什麼目的所為？這起案件和「第九」「ＭＲＩ調查」毫無關連嗎──薪和青木在進行調查的途中，查明的真相會是…

在小學裡，因不幸的巧合疊加而發生一件哀傷的意外。 接著在哀傷的深淵當中，一名父親引發不幸的事件。 不過是連續的巧合，任誰都那麼想…除了薪以外。 逼近青木，美少年‧須田光的魔手是？ 與死者腦部有關的精湛懸疑作品，惡作劇（遊戲）篇，啟動…！

法醫第九研究室是運用MRI技術來調查懸案的單位。最近發生了貝沼事件前的「第九」內部人員洩露調查情報的事件？在這樣的疑惑下，薪的車子被裝置炸彈！然而這不過是一連串事件的開始…最高傑作系列，衝擊的第9集！

時間回溯到三年前。在看過殺人犯貝沼的腦部後，法醫第九研究室瀕臨瓦解邊緣，成員中唯有薪室長倖存下來。為了重振「第九」的聲勢，當時還是搜查一課菁英份子的岡部被調到「第九」，抽絲剝繭找出連續砍殺事件的真相！

元首被刺身亡却找不出凶手。于是调查单位采用最先进的技术，把储存在总统脑中的影像播放出来。然而透过总统的眼睛看到的事件真相，却让所有的人不解。

一名垂死老人向神父懺悔，表示他曾在多年前殺害一名兒童加以掩埋。但當警方前往埋屍地點挖掘時，發現的卻是另外一起案件的屍體。法醫雪子力主應該進行MRI調查，將真凶繩之以法，但不知為何，薪室長卻持反對意見？

科学警察研究所——法医第九研究室取出犯罪被害者的脑部，使用重现生前影像记忆的技术，追查棘手案件的真相。地震发生后，某所小学发现三名死者，他们的死因是震灾？意外？还是案件？在调查后，揭露出意想不到的事实！

在發生撼動「第九」的內部人員洩密案後，青木的姊姊及姊夫被殺。化悲憤為力量的青木全力緝凶，而行跡可疑的瀧澤則恢復原職。接著在調查過程中出現謎樣的維吾爾族文字…手中握有本案重大「機密」的薪會採取什麼行動？